子どもの便秘・腹痛・お腹の張りに。腸内細菌検査(腸内フローラ検査)で根本から整える|小森こどもクリニック|小児科|栄養外来・便秘専門外来なら小森こどもクリニック|根本治療に対応

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子どもの便秘・腹痛・お腹の張りに。腸内細菌検査(腸内フローラ検査)で根本から整える|小森こどもクリニック

子どもの便秘・腹痛・お腹の張りに。腸内細菌検査(腸内フローラ検査)で根本から整える|小森こどもクリニック|小児科|栄養外来・便秘専門外来なら小森こどもクリニック|根本治療に対応

2026年6月20日

子どもの便秘・腹痛・お腹の張りに。腸内細菌検査(腸内フローラ検査)で根本から整える|小森こどもクリニック

お子さんの腸内環境を「見える化」する

「便秘がなかなか良くならない」「お腹が張る・ガスが多い」「原因がわからない腹痛を繰り返す」——。

こうしたお子さんの不調の背景には、お腹の中の「腸内環境(腸内細菌のバランス)」が関わっていることがあります。

私たちの腸の中には、何百種類もの細菌がすみついていて、お互いにバランスを取りながら、消化・吸収や免疫、こころの安定にまで関わっていることがわかってきました。このバランスは、これまで目で見ることができませんでした。

当院の「お腹と栄養の外来」では、この腸内環境の状態を検査で「見える化」し、お子さん一人ひとりに合った食事や生活習慣の見直しにつなげていきます。

「お腹の専門家」だからこそ行う腸内細菌検査

当院の腸内細菌検査には、他の医療機関にはない特徴があります。

院長の小森は、小児外科専門医として25年以上にわたり子どもたちの消化管を診てきました。年間5,000組以上の便秘診療を行う「お腹の専門家」でもあります。

腸の構造と機能を熟知した小児外科専門医が、腸内環境という「機能」の側面と、栄養という「材料」の側面の両方から、お子さんのお腹を総合的に診る——。これが、当院の「お腹と栄養の外来」の考え方です。

検査の数値だけを見るのではなく、お子さんの症状・食生活・便の様子とあわせて読み解き、ご家庭で無理なく続けられる形で食事や生活習慣の改善につなげていきます。

なぜ、腸内細菌検査を実施するのか(検査の意味)

腸内環境は、便秘の治療や栄養療法の「土台」になる大切な部分です。

しかし、腸内環境の個性は一人ひとりまったく異なります。 「お腹の調子が悪いから」と、良かれと思ってヨーグルトや食物繊維(腸活)を頑張った結果、かえってガスが溜まって苦しくなってしまうお子さんも少なくありません。

一番お腹が荒れている時に必要なのは、「腸活(=足すこと)」ではなく「鎮火(=火事を鎮めること)」である場合が多いのです。当院では、腸内環境を立て直すために**

①引く(鎮火)

 ↓

②流す(渋滞解除)

 ↓

③修復する

 ↓

④育てる

という4つのステップを大切にしています。

「なんとなく良さそうだから」と闇雲に腸活やサプリメントを試すのではなく、「いま、お子さんの腸がどのステップ(状態)にいて、何を引いて、何を育てていくとよいか」を客観的に把握することが、遠回りに見えて実は一番の近道になります。

✔ 腸内細菌の多様性(バランスの豊かさ)

✔ ビフィズス菌など、有益な菌の割合

✔ 酪酸など、腸を元気にする「短鎖脂肪酸」をつくる菌の状態

✔ 全体のバランスから見える「いまの腸内環境の傾向」

これらを「地図」として手に入れることで、自信を持って日々の食事や栄養改善に取り組むことができるようになります。

こんな方におすすめです

・ 便秘や腹部の張り、ガス、繰り返す腹痛が気になるお子さん

・ 食生活を見直しても、なかなか体調の変化を感じにくいお子さん

・ 偏食が強く、腸の状態が気になるお子さん

・ まずは「自分の腸内環境がどんな状態なのか」を知りたい方

・ サプリメントや食事改善に、客観的な根拠を持って取り組みたい方

当院で受けられる「二段構え」の腸内細菌検査

お子さんの状態や、ご家庭が「どこまでしっかり取り組みたいか」というご希望に合わせて、2種類の腸内細菌検査をご用意しています。

1. Mykinso(マイキンソー)— まずは腸内環境の全体像を知りたい方へ

腸内細菌の基本的なバランス(多様性、ビフィズス菌、酪酸をつくる菌など)を調べる検査です。

「まずは自分の腸内環境を知りたい」「日々の食事や生活習慣(腸活)の指標にしたい」という方に向いています。検査結果をもとに、ご家庭でできる食事の工夫を一緒に考えていきます。

→検査料金:27,500円

2. MicroBio Me(マイクロバイオミー)— 詳しい分析から、具体的な栄養アプローチまで知りたい方へ

より詳しく腸内細菌のバランスを分析し、その結果に基づいて「いま必要な栄養素」や「お子さんに合ったサプリメントの選び方」までを一気通貫でアドバイスする、より専門的な検査です。

「本気で腸内環境を整えたい」「自分に合う食事やサプリメントを、客観的な根拠を持って選びたい」という方に向いています。

→検査料金:44,000円

【当院の腸内細菌の検査の料金】

どちらを選べばよいか迷ったら

当院では、まずMykinso(マイキンソー)から始めることをおすすめしています。腸内細菌の全体的なバランス(多様性、善玉菌の割合、発酵しやすさの傾向など)を把握し、食事の「足し算・引き算」の方向性を立てるための検査として、十分な情報が得られます。

Mykinsoの結果だけでは判断が難しい場合や、より広い視点で腸内環境を分析したいお子さんには、次のステップとしてMicroBio Me(マイクロバイオミー)をご提案しています。より詳細な菌叢の分析に加え、具体的な栄養・サプリメント選びのアドバイスまで含めた専門的な検査です。MicroBio Meは原則6歳以上が対象ですが、6歳未満のお子さんについても、症状やご希望に応じてご相談いただけます。

迷われる場合は、診察の際に医師がお子さんの状態に合わせてご提案しますので、ご安心ください。

検査の流れ

腸内細菌検査は、ご自宅で採便していただくため、お子さんへの身体的な負担がほとんどありません。

ステップ1:診察・検査のご説明 

まずは外来でお子さんの症状やお腹の状態を確認し、腸内細菌検査が向いているかを判断します。検査の内容や採便の方法を、丁寧にご説明します。

ステップ2:

ご自宅で採便 検査キットをお渡しします。ご自宅でお子さんの便を採取し、郵送していただきます。

ステップ3:

結果のご説明(約2〜3週間後) 検査結果をもとに、腸内細菌の多様性や、有益な菌・気になる菌のバランス、腸の状態をわかりやすくご説明します。その上で、お子さんに合った食事の工夫や、必要に応じてサプリメントをご提案します。

ステップ4:

継続フォロー・再検査 食事や生活習慣の改善に取り組んだあと、一定期間をおいて再検査を行うことで、腸内環境の変化を客観的に確認することもできます。「整えてきた腸の状態」を数値で見られることが、お子さんやご家族の励みにもつながります。

検査の対象年齢と、当院の考え方

腸内細菌検査は、3歳以上のお子さんから受けていただくことができます。

「腸活」というと、「食物繊維や善玉菌の餌になるものを、とにかくたくさん食べさせればいい」と思われがちです。しかし、実はそんなに単純な話ではありません。

腸内環境で一番大切なのは「バランス」です。
「体に良い」と言われる水溶性の食物繊維やビフィズス菌、ヨーグルトなども、お子さんの現在の腸内細菌のバランスによっては、かえってガスを増やしてしまったり、お腹の張りを悪化させたりする原因になることがあります。良かれと思って頑張って続けていることが、実はお子さんの今の腸には合っていない「見えないミスマッチ」が起きていることも少なくないのです。

腸内細菌検査の最大の価値は、いま現在の腸のバランス(現在地)を知り、「何を引いて、何をどんな形で足していけばよいか」の方向性をつけることにあります。

・どんな種類の食物繊維(水溶性・不溶性)が今の腸に合っていそうか
・いまは発酵食品を足していい時期か、それとも「引く(消化の負担を減らす)」時期か
・善玉菌を育てるために、どのような「餌」を選んで入れていくとバランスが整いやすいか

このように、やみくもに足し算をするのではなく、腸内細菌のバランスを整えるための「判断材料」として使うことで、よりお子さんに合った確かなアプローチが可能になります。

3歳未満のお子さんについては、腸内環境がまだ大きく変動する時期のため、原則として検査は行わず、臨床評価(便通・腹部所見・食事内容など)をもとに判断しています。

検査のあとが、いちばん大切です

腸内細菌検査は、「調べて終わり」ではありません。大切なのは、その結果をもとに腸内環境を育てていくことです。

当院では、検査結果をふまえて、食物繊維や発酵食品の取り入れ方、タンパク質の摂り方など、ご家庭で無理なく続けられる食事の工夫をお伝えします。必要に応じて、腸内環境を整えるサポートとして医療用サプリメントもご提案します。

オーソモレキュラー・ニュートリション・エキスパート(ONE)の資格を持つ栄養カウンセラーが、お子さんとご家族に寄り添いながら、一緒に腸を育てていきます。

費用について(自費診療)

腸内細菌検査は自費診療となります。お子さんの状態や目的に合わせて、2つのコースからお選びいただけます。

【当院の腸内細菌の検査の料金】

よくあるご質問

Q. 痛みや、お子さんへの負担はありますか? A. ご自宅で便を採取していただく検査ですので、採血のような痛みはありません。お子さんへの身体的な負担はほとんどありません。

Q. 便秘やアレルギーは、この検査で治りますか? A. 腸内細菌検査は、病気を診断したり治したりする検査ではありません。お子さんの腸内環境の「いまの状態」を知り、食事や生活習慣を見直していくための地図として活用するものです。腸内環境を整えることは、便秘の治療や栄養療法を進めるうえでの大切な土台になります。

Q. 検査結果はどのくらいで出ますか? A. 採便して郵送いただいてから、約2〜3週間で結果が出ます。結果が届きましたら、あらためてご説明の機会を設けます。

Q. 検査だけ受けることはできますか? A. まずは外来でお子さんの状態を確認したうえで、検査が向いているかを判断します。お子さんにとって本当に必要かを見極めながらご提案しますので、ご安心ください。

ご予約・お問い合わせ

腸内細菌検査は、お腹と栄養の外来(完全予約制)の中でご提供しています。

ご予約は、当院ホームページの初診のご案内・予約ページから、予約システム(デジスマ診療)へお進みください。 (※初診時の注意事項などを事前にご確認いただくため、ホームページを経由してご予約いただいております)

栄養や腸内環境に関するご質問は、当院の栄養の公式LINE(※実際のLINE URLに差し替えてください)からお気軽にお問い合わせいただけます。ご登録いただいた方には「栄養療法スタートアップガイド」を無料でお届けしています。

お腹と栄養の両面から、お子さんの体の土台を一緒に整えていきましょう。詳しくは**栄養外来**のページもあわせてご覧ください。

監修者プロフィール

小森こどもクリニック 院長 小森 広嗣(こもり こうじ)

慶應義塾大学医学部卒。都立小児総合医療センター外科医長などを経て小森こどもクリニックを開院。 小児外科専門医として数多くのおなか(消化管)の手術や治療に携わり、「こどものお腹のスペシャリスト」として消化管の構造と機能に精通する。

自身や家族の不調が栄養療法で改善した手応えから、「西洋医学だけでは届かない不調」の解決策として「栄養」の重要性を確信。 「吸収の場である腸」と「体の材料となる栄養」の両面から、標準治療と分子栄養学を柔軟に組み合わせ、その子の体の土台を根本から整える「統合的な医療」を実践している。 日本小児外科学会認定専門医・指導医、医学博士。

👉 小森広嗣 日々の発信(X)はこちら @KomoriKodomoCL

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